La selección correcta del análisis de compuestos volátiles es muy importante porque el tiempo y el equipo necesarios son diferentes para cada metodología. La destilación por lotes es el sistema más común utilizado en un laboratorio, ya que es fácil y barato. Sin embargo, la vida útil de la columna de cromatografía puede reducirse mediante muestras que tienen un alto contenido de agua. La extracción con disolvente permite obtener muchos compuestos volátiles, pero es necesario un GC-MS para identificar los compuestos deseados y GC-FID para cuantificarlos, se necesita mucha muestra a la extracción y también los solventes son peligrosos para el operador y para el medio ambiente.
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