Se presentan varias aproximaciones de modelación del balance hídrico de sistemas cenagosos fluviales y costeros compuestos por uno o más cuerpos de agua interconectados entre sí, e interactuando con ríos y/o el mar. La modelación está basada en la ecuación de continuidad y en el comportamiento hidráulico de las conexiones. Se muestran las aproximaciones utilizadas para la ciénaga Grande de Santa Marta y el complejo lagunar de Pajaral, las ciénagas de Zapatosa y La Rinconada - Tesca, y la región de La Mojana. Se ilustran los diferentes tipos de resultados que estos modelos pueden suministrar, importantes para el conocimiento de estos ecosistemas frágiles por naturaleza, para su recuperación, preservación, uso y manejo adecuado.
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