Se usaron métodos microbiológicos clásicos, en asociación con métodos moleculares (amplificación de ADN, Electroforesis de Gel de Gradiente de Temperatura (TGGE) y Electroforesis de Gel de Gradiente de Desnaturalización (DGGE))
Estos métodos, desarrollados para analizar rápidamente comunidades microbianas sobre la base de separación específica de secuencias de amplicones de ADN, permitieron la detección de diferencias en los amplicones probados y la identificación las cepas analizadas por comparación de secuencias desconocidas con secuencias de especies conocidas. La TGGE permitió la comparación de las diferentes cepas de Saccharomyces cerevisiae usadas en fabricación de cerveza, mientras que la DGGE permitió la identificación de bacterias acidolácticas en la cerveza.
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