La adaptación local es el primer paso en el proceso de especiación ecológica. Sin embargo, es una situación inestable y dinámica. Puede verse reforzada por la aparición de alelos más especializados en los distintos hábitats o desaparecer si surgen alelos generalistas por mutaciones y aumenta su frecuencia. Este proceso puede tener una dinámica complicada, ya que los alelos especialistas pueden ser mucho más comunes y mantener la adaptación local durante mucho tiempo. Por tanto, incluso en ausencia de un equilibrio absoluto entre hábitats, la adaptación local puede persistir durante mucho tiempo antes de desaparecer. Además, varios bucles de retroalimentación pueden ayudar a mantenerla (los bucles de refuerzo, demográfico y de recombinación). Este refuerzo puede producirse modificando uno de los tres pasos fundamentales del ciclo de vida sexual (dispersión, singamia, meiosis), lo que favorece la agrupación genética al provocar asociaciones genéticas específicas. La distinción de estos mecanismos complementa la clasificación de uno frente a dos alelos. En general, las tasas relativas de los dos procesos (especialización y refuerzo) dictan si se producirá la especiación ecológica.
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