El contenido limitado de nitrógeno (N) en el suelo es un reto importante para la producción sostenible y elevada de cultivos en muchos países en desarrollo. La simbiosis fijadora de nitrógeno de las leguminosas con los rizobios desempeña un papel importante en el suministro de N suficiente para las leguminosas y los cultivos no leguminosos subsiguientes. Para identificar las cepas de rizobios adecuadas para la producción de bioinoculantes, la caracterización de los rizobios es un requisito previo. El objetivo de este estudio era evaluar la diversidad morfológica y genética de los rizobios que nodulan el caupí en suelos agrícolas del bajo este de Kenia. Se recuperaron 28 aislados de rizobios de muestras de suelo recogidas en campos de agricultores de los condados de Machakos, Makueni y Kitui, en el bajo este de Kenia, y se caracterizaron en función de sus características morfológicas. Se seleccionaron trece aislados representativos y se caracterizaron utilizando la huella digital por PCR de elementos repetitivos BOX. Basándose en el dendrograma generado a partir de las características morfológicas, los aislados de la prueba se distribuyeron en dos grupos principales con una similitud del 75%. El árbol filogenético, basado en la PCR de elementos repetitivos BOX, agrupó los aislados en dos conglomerados con un nivel de similitud del 90%. La agrupación de los aislados no mostró relación con el origen de las muestras de suelo, aunque los aislados eran genéticamente diversos. Este estudio es un prerrequisito para la selección de rizobios del caupí adecuados para desarrollar bioinoculantes para la producción sostenible de cultivos en Kenia.
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