Los contaminantes emergentes en la naturaleza están relacionados con diversos perjuicios agudos y crónicos en los componentes bióticos y deterioran posteriormente el ecosistema con graves peligros. Los métodos convencionales de eliminación de contaminantes no son eficaces, sino que acaban formando contaminantes secundarios. Los principales efectos destructivos de los contaminantes son los trastornos perinatales, la mortalidad, los trastornos respiratorios, la alergia, el cáncer, los trastornos cardiovasculares y mentales y otros efectos nocivos. El sustrato contaminante puede reconocer diferentes enzimas microbianas en condiciones óptimas (temperatura/humedad/tiempo de contacto/concentración) para transformarlos eficazmente en otros productos más bien inocuos. Las enzimas más representativas implicadas en la biorremediación incluyen citocromos P450, lacasas, hidrolasas, deshalogenasas, deshidrogenasas, proteasas y lipasas, que han mostrado un prometedor potencial de degradación de polímeros, hidrocarburos aromáticos, compuestos halogenados, tintes, detergentes, compuestos agroquímicos, etc. Esta biorremediación se ve favorecida por diversos mecanismos, como la oxidación, la reducción, la eliminación y la apertura de anillos. La degradación significativa de los contaminantes puede mejorarse utilizando microorganismos modificados genéticamente que producen muchas enzimas recombinantes mediante una nueva tecnología respetuosa con el medio ambiente. Hasta la fecha, se han explotado pocas enzimas microbianas y la gran diversidad microbiana sigue sin explorarse. Esta revisión también sería útil para futuras investigaciones destinadas a mejorar la eficacia de la degradación de contaminantes xenobióticos, incluidos los agroquímicos, los microplásticos, los compuestos polihalogenados y otros hidrocarburos.
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