Se investigó la relación entre las variables ambientales, la composición y la estructura de las comunidades bacterianas en diferentes hábitats de un manglar situado cerca de una zona de explotación petrolífera, con el objetivo de recuperar el patrón natural de las comunidades bacterianas en este ecosistema. El análisis T-RFLP mostró una alta diversidad de poblaciones bacterianas y un aumento de la riqueza bacteriana desde los hábitats más cercanos al mar y sin vegetación (S1) hasta los hábitats cubiertos por Avicennia schaueriana (S2) y Rhizophora mangle (S3). Las variables ambientales en S1 y S2 fueron más similares que en S3; sin embargo, al comparar las composiciones bacterianas, S2 y S3 compartieron más OTUs entre ellas, lo que sugiere que la presencia de vegetación es un factor importante en la conformación de estas comunidades bacterianas. Los análisis in silico de los fragmentos revelaron una alta diversidad de la clase Gammaproteobacteria en los 3 sitios, aunque en general presentaban una composición bacteriana bastante diferente, que probablemente esté moldeada por las especificidades de cada hábitat. Este estudio muestra que los microhábitats dentro de un ecosistema de manglar albergan una microbiota diversa y distinta, lo que refuerza la necesidad de conservar estos ecosistemas en su conjunto.
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