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Método acoplado Autodock–PM6 para seleccionar la mejor pose en estudios de acoplamiento molecular

Coupled Autodock-PM6 method to select the best pose in molecular docking studies

Autor: Velásquez, Margarita; Drosos, Juan; Gueto, Carlos; Márquez, Johana; Vivas–Reyes, Ricardo.
Categoria: Ciencias naturales y subdisciplinas | Subcategoría: Físicoquímica.
Año de publicación: 2013.
Editor:

Universidad Nacional de Colombia. Facultad de Ciencias. Departamento de Química.

.

Tipo de documento: Artículo | Formato: pdf. | Idioma: Español. | Tamaño: 2114 Kb.

Resumen:

El Acoplamiento Molecular (Docking) es una técnica de Mecánica Molecular ampliamente utilizada para predecir energías y modos de enlace entre ligandos y proteínas, lo que proporciona información de gran utilidad para el estudio de nuevos compuestos con efectos terapéuticos. No obstante, los resultados obtenidos mediante esta técnica tienden a la subjetividad, debido a que los programas utilizados para llevarla a cabo proporcionan más de un criterio de selección de la mejor pose. En la presente investigación, se aplicó el método semiempírico PM6 a los resultados del acoplamiento, obteniendo con ello mejorarías en el proceso de selección de la mejor pose al observarse finalmente poses con alta probabilidad de unión al sitio activo de su receptor y con energías de unión menores a las reportadas por los criterios de selección ofrecidos por el programa de Docking.

Materias: Química inorgánica Dinámica molecular

Subjects: Chemistry inorganic Molecular dynamics

Palabras clave: Acoplamiento molecular, Método semiempírico PM6, Autodock, Pose

Keywords: Molecular coupling, PM6 semi-empirical method, Autodock, Pose

DC.Title.spa
 Método acoplado Autodock–PM6 para seleccionar la mejor pose en estudios de acoplamiento molecular
DC.Title.eng
 Coupled Autodock-PM6 method to select the best pose in molecular docking studies
DC.Creator
 Velásquez, Margarita; Drosos, Juan; Gueto, Carlos; Márquez, Johana; Vivas–Reyes, Ricardo
DC.Subject.snpi.spa
 Química inorgánica Dinámica molecular
DC.Subject.snpi.eng
 Chemistry inorganic Molecular dynamics
DC.Subject.spa
 Acoplamiento molecular, Método semiempírico PM6, Autodock, Pose
DC.Subject.eng
 Molecular coupling, PM6 semi-empirical method, Autodock, Pose
DC.Description.spa

El Acoplamiento Molecular (Docking) es una técnica de Mecánica Molecular ampliamente utilizada para predecir energías y modos de enlace entre ligandos y proteínas, lo que proporciona información de gran utilidad para el estudio de nuevos compuestos con efectos terapéuticos. No obstante, los resultados obtenidos mediante esta técnica tienden a la subjetividad, debido a que los programas utilizados para llevarla a cabo proporcionan más de un criterio de selección de la mejor pose. En la presente investigación, se aplicó el método semiempírico PM6 a los resultados del acoplamiento, obteniendo con ello mejorarías en el proceso de selección de la mejor pose al observarse finalmente poses con alta probabilidad de unión al sitio activo de su receptor y con energías de unión menores a las reportadas por los criterios de selección ofrecidos por el programa de Docking.

DC.Source
 ...vistas.unal.edu.co/index.php/rcolquim/article/view/44409
DC.Identifier.virtualpro
 http://www.revistavirtualpro.com/biblioteca/metodo-acoplado-autodock-pm6-para-seleccionar-la-mejor-pose-en-estudios-de-acoplamiento-molecular
DC.Identifier.issn-isbn
 ISSN:0120-2804 (versión impresa) ; 2357-3791 (versión online)
DC.Identifier.citacion
 Revista Virtual Pro, ,
DC.Language
 Español
DC.Relation
 
DC.Publisher

Universidad Nacional de Colombia. Facultad de Ciencias. Departamento de Química.

DC.Contributor
 
DC.Rights
 Derechos de autor:Atribución
DC.Date
 2013
DC.Type
 Artículo
DC.Format
 pdf
DC.Identifier.file
13000.pdf

Descarga: Método acoplado Autodock–PM6 para seleccionar la mejor pose en estudios de acoplamiento molecular.
Tipo de documento: Artículo | Formato: pdf. | Idioma: Español. | Tamaño: 2114 Kb.
Categoria: Ciencias naturales y subdisciplinas | Subcategoría: Físicoquímica.
Fecha de publicación Virtual Pro: 2018-03-22.


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